為積極回應中央政府於2019年2月頒佈的《粵港澳大灣區發展規劃綱要》，香港中文大學在擁有國際視野、全球接軌、出色研究的高水準教育水準，及 “一國兩制”的雙重優勢下，於2020年8月成立粵港澳大灣區發展辦公室（Office for Greater Bay Area Developments, 簡稱：GBAO），更積極主動地參與大灣區的發展，促進大學新的戰略計劃。GBAO將協助大學投入參與大灣區的建設，為大學成員在大灣區的學研提升、創新創業等活動提供適切的支援，同時加強與各地政府、企業合作夥伴、產業機構及校友組織等的溝通與聯繫，推進和落實大學在大灣區的各項目的工作。

自2000年代初以來，香港中文大學已經主動在大灣區發展了一系列的項目，包括於2006年2月與中國科學院（Chinese Academy of Sciences，簡稱：CAS）和深圳市政府共同建立了深圳先進技術研究院（ Shenzhen Institutes of Advanced Technology，簡稱：SIAT）；於2007年5月在內地設立全資擁有的香港中文大學深圳研究院（Shenzhen Research Institute，簡稱：SZRI）；2009年建立了香港中文大學（深圳）校區（The Chinese University of Hong Kong (Shenzhen), 簡稱：CUHKSZ）；2019年成立香港中文大學-廣州再生醫學與健康廣東省實驗室再生醫學高等研究院；2020年新成立的香港中文大學深港創新研究院（福田）（ Hong Kong-Shenzhen Innovation and Technology Research Institute (Futian)，簡稱：FITRI），以及早前與大灣區不同高校及研究機構合作成立的多個聯合研究中心。